Если в KDE 4.3.2 включить эффекты рабочего стола все работает до перезагрузки системы. После каждой перезагрузки эффекты рабочего стола отключаются. При этом если зайти в Параметры системы/Рабочий стол/Эффекты рабочего стола то там будет написано, что графические эффекты временно приостановлены». При нажатии на кнопку «возобновить», в области уведомлений появляется сообщение о том, что эффекты отключены другим приложением, нажмите alt+shift+f12. И только при нажатии на даное сочетание кнопок или повторной попытке включить эффекты все воостанавливается.

Проблема решается установкой флажка «Отключить внутреннюю проверку» на вкладке Дополнительно.

Собственно, уже разобрался. Включил в настройках OpenGL флажок «Отключить внутреннюю проверку».

Перезагружаем компьютер и наслаждаемся :)